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整合多组学数据推测细胞转分化中关键蛋白质激酶的方法

公开(公告)号:CN109536473A

申请日:2018.12.19

公开(公告)日:2019.03.29

分类号:C12N9/12(2006.01)I

申请(专利权)人:华中科技大学鄂州工业技术研究院;华中科技大学

申请日期:2018.12.19

本发明公开了整合多组学数据推测细胞转分化中关键蛋白质激酶的方法,包括以下步骤:准备整个细胞转分化过程中的细胞样本,将其分成转录组和蛋白质磷酸化组,并分别通过组学检测获得每组相应的原始数据;对原始数据进行预处理,通过转录组筛选表达显著差异的蛋白质激酶,通过蛋白质磷酸化组筛选活性显著差异以及调控显著差异的蛋白质激酶;整合所有存在显著差异的蛋白质激酶,综合衡量,得出关键蛋白质激酶。本发明所述方法能够为细胞转分化的机制研究提供小规模的候选激酶,为细胞转分化机制的研究提供指导方向,极大程度缩小筛选范围,提高研究效率和实验的准确性,变相缩短研发周期,提高实验成功率,降低细胞分化机制研究成本。